مرجع عالیقدر حضرت آیت الله العظمی موحدی نجفی(مدظله العالی) در حاشیه درس خارج اصول شهادت مظلومانه عالم مجاهد و مبارز شیخ النمر باقر النمر را تسلیت عر ض نمودندو همچنین محکومیت و اعتراض خود را نسبت به این جنایت آشکار و ظالمانه آل سعود و حامیان مستکبرش ابراز کرده و درس خارج اصول و تفسیر قرآن کریم خود را تعطیل نمودند.
معظم له در این باره فرمودند: این جنایت ضد بشری در بین تمام انسان ها و مسلمین محکوم است این جانیان نیز می‌دانند به انتقام خدای تبارک و تعالی از ظالمین دچار خواهند شد همان طورکه خداوند در قرآن کریم می‌فرماید: فَقُطِعَ دَابِرُ الْقَوْمِ الَّذِینَ ظَلَمُواْ وَالْحَمْدُ للَّهِ رَبِّ الْعَلَمِینَ (ریشه‌ى گروه ستمكاران بریده شد و سپاس، مخصوص خداوندى است كه پروردگار جهانیان است) و همچنین در آیه دیگر آمده وَ مَن قُتِلَ مَظلوماً فقد جعلنا لِوَليه سُلطاناً ... (هركس مظلوم كشته شود ما براي ولي‌خون او سيطره و سلطنت قرار مي‌دهيم ...). علاوه برانتقام خداوند متعال از این جنایتکاران، مسلمین نقاط مختلف جهان نسبت به این جنایت آشکار سکوت نخواهند کرد. تاریخ عبرتهای زیادی برای این ظالمین دارد مانند صدام که به فجیع ترین وجه کیفر و مجازات شد، قذافی که این همه شاخ وشانه می‌کشید به چه عاقبتی مبتلا شد و امثال این جانیان بسیار است که دست انتقام الهی آنها را نابود کرده است ولیکن این ظالمین وحشی عبرت نمی‌گیرند. انشاالله اعدام کنندگان این شهید مظلوم و روحانی مبارز، ملک سلمان و سایر ظالمین آل سعود در دادگاه انتقام الهی مبتلا به کیفر و مجازات اعمال خود شوند .