تأسيس مدرسه علمیه امام زمان(عج)
مدرسه علميه امام زمان(عج) در قم به عنوان يك پايگاه علوم اسلامي ملجأ و پناهي براي طلاب بي‌پناه و نيازمند به شمار مي‌آيد كه از بركت وجود و تلاشهاي پي‌گير مرجع گرانمايه حضرت آيت‌الله العظمي موحدي نجفي«مدظله‌العالي» در راه انجام وظيفه و اداء مسئوليت سالهاست كه به ثمر رسيده است.
مدرسه علميه امام زمان(عج) در سال1370ه.ش ـ 1412ه.ق در شهر مقدس قم با هدف تحت پوشش گرفتن طلاب بدون شهريه و مسكن تأسيس يافت و از همان آغاز تا كنون فعاليت‌هاي مفيد و سودمندي را براي مردم و طلاب، به‌خصوص طلاب و مهاجرين كشور افغانستان ارائه داشته است.
تأسيس مدرسه علمیه امام حسن عسکری(ع)
اين مدرسه نيز همانند مدرسه علميه امام زمان(عج) با همان نيت و اهداف در سال 1375ه.ش در مشهد مقدس تأسيس گرديد كه از بدو تأسيس تا زمان حاضر منبع خير براي طلاب و مردم مهاجر آن ديار مي‌باشد.
اهم فعاليت‌هاي اين دو مدرسه به اختصار چنين است:
1ـ برقراري كلاس‌هاي آموزشي حوزه‌اي
در اين دو مدرسه با آغاز سال تحصيلي حوزه، دروس متناسب با نياز طلاب توسط اساتيد برجسته تدريس مي‌شود، درس‌هايي كه تاكنون براي طلاب تدريس گرديده عبارتند از: جامع المقدمات، سيوطي، اصول فقه، لمعه، مكاسب محرمه، تفسير قرآن كريم، تجويد و... .
2ـ برقراري كلاس‌هاي آموزشي غيرحوزه‌اي
دروس غيرحوزوي مانند كلاس زبان انگليسي، كامپيوتر، آموزش قرآن كريم (روخواني، لحن، صوت، تجويد)، فن خطابه و... براي عموم علاقمندان در ايام غير درسي، به‌خصوص در ماه‌هاي تعطيلي تابستان طي دوره‌هاي مختلف برگزار شده است و فعال مي‌باشد.
3ـ مساعدت نقدي و مالي به طلاب و افراد نيازمند
به مناسبتهاي مختلف مانند نيمه‌ي شعبان، عيد غدير، ماه رمضان و مواليد ائمه معصومين (عليهم السلام) و... براي طلاب مساعدت شده و مي‌گردد. به خصوص سالهاست كه در مدرسه علميه امام زمان(عج) به مناسبت ماه مبارك رمضان به طلاب افطاري و سبد كالا داده مي‌شود. همچنين در اين ماه و مناسبتهاي مهم ديگر به تناسب براي طلاب محروم و مردمان نيازمند، اقلام خوراكي و غذایی توزیع مي‌شود.
4ـ اعزام مبلغ و مدرس به افغانستان
از خدمات بسيار مهم اين مدارس نسبت به جامعه‌ي افغانستان ميتوان همين اعزام مبلغ و مدرس را ذكر نمود. مدرسه علميه امام زمان(عج) با توجه به امكانات محدود خود از بدو تأسيس تاكنون هر ساله تعدادي مبلغ براي ارشاد مردم و تبليغ احكام ديني و مدرس براي آموزش و تدريس طلاب نيازمند به ولايات مختلف افغانستان (ارزگان، دايكندي، ميدان، باميان، غور، هلمند، هرات، كابل، بلخ و... ) اعزام نموده است، كه اين روند همچنان ادامه دارد.
بنیانگذاری مدارس علمیه امام حسن مجتبی(ع)
اين مدرسه به علت آماده نشدن ساختمان آن به طور موقت در دفتر معظم‌له (کابل) برقرار مي‌باشد که در آن جمع کثیري از طلاب علوم دینی زیر نظر استاد امینی غزنوی آموزش و تحصيل مي‌كنند و در صورت قبولي زیر پوشش شورای مدیریت علوم حوزوی کابل قرارگرفته، اداره می‌شوند. همچنین مدرسه‌ی علمیه دیگری به نام امام حسن مجتبی(ع) در منطقه بهسود (برمک) در سال 1390ه.ش تأسیس شده است که محل آموزش طلاب و مكاني جهت برگزاری نماز جمعه در اختیار مردم شریف آن سامان قرار گرفته است.
بنيان‌گذاري حوزه علميه در هرات
مرجع عاليقدر، علاوه بر مدارس یاد شده، حوزه علميه ولیعصر(عج) را در افغانستان (شهر هرات) بنيان نموده است كه هم اكنون پذيراي طلاب براي تحصيل از مناطق مختلف افغانستان مي‌باشد.
تأسيس كتابخانه رسالت
در سال 1360ه.ش در مشهد مقدس با همكاري جمعي از دوستان اهل علم كتابخانه‌اي به نام كتابخانه رسالت براي استفاده عموم، به‌ويژه محصلين مهاجر افغانستاني بنيان گذاشته شد كه اين كتابخانه از آن زمان علاوه بر استفاده علمي، مكان مهمي براي بسياري از رويداهاي تاريخي مهاجرين بوده است. و اكنون نيز مورد استفاده مردم و دانشجويان مي‌باشد.
تأسيس مجامع و مهدهاي قرآني
از سوي مرجع عاليقدر حضرت آيت‌الله العظمي موحدي نجفي«مدظله‌العالي» براي آشنايي طبقه عوام جامعه و انس بيشتر آنها با كلام وحي، مجامع و مهدهاي قرآني در شهرهاي اصفهان، تهران و مشهد تأسيس شده است كه برخي از آنها عبارتند از:
1ـ مجمع قاريان قرآن افغانستان
2ـ مجمع قاريان قرآن ياسين
3ـ مجمع آموزشي قاريان قرآن كوثر(ويژه بانوان)
4ـ هيئت متوسلين به امام زمان(عج)
5ـ هيئت متوسلين به موسي بن جعفر. اين كانون و هيئت‌هاي قراني سالهاست كه به فعاليت مشغولند و شعباتي نيز در افغانستان دارند.
سرپرستي مجتمع آموزش عالی حقوق شـهيد بلخي
در سال 1368ه.ش در راستاي تربيت تعدادي قاضي جهت خدمت در افغانستان، مجتمع آموزش عالي حقوق شهيد بلخي با كوشش شهيد مزاري و حمايت مالي مركز جهاني علوم اسلامي و تحت سرپرستي مرجع عاليقدر حضرت آيت‌الله العظمي موحدي نجفي«مدظله‌العالي» در شهر قم افتتاح شد و نزديك به 70 دانشجو از قشر طلاب در آن مشغول به تحصيل در رشته حقوق شدند.
مرجع عاليقدر در چگونگي شكل‌گيري اين مجتمع مي‌فرمايد: «سردار رشید اسلام شهید مزاري به همراه هيئت بلند‌پايه‌اي از رهبران احزاب در راستاي تحكيم بناي حزب وحدت به ايران سفر نمود. كه اتفاقاً آخرين سفر ايشان هم بود. در اين سفر، ايشان و هيئت همراه با مقامات بلندپايه سياسي و فرهنگي ايران، مقام‌معظم رهبری و مراجع تقليد ديدارهايي داشتند. پس از اتمام اين ديدارها در آخرين مرحله ايشان براي ديدار بنده و ارائه گزارش و مشورت در پاره‌اي امور، به منزل اينجانب تشريف‌آوردند. در اين ديدار 4 ساعته كه از ساعت 11شب آغاز و تا نزديكيهاي اذان صبح ادامه يافت، ايشان ضمن بيان ملاقات‌ها با مسئولين ايراني و مراجع تقليد كه چه گفتيم و چه گفتند، يازده نكته محرمانه را در راستاي تشكيلات سياسي، اجتماعي، فرهنگي حزب وحدت و آينده شيعيان افغانستان به لحاظ مسائل درون مرزي و برون مرزي طرح كردندكه بنده به جهت كاربردي بودن آنها، تاكنون براي هيچ‌كس بيان نكرده‌ام و تا رسيدن زمان مناسب بيان هم نخواهم كرد.
...از جمله در اين ديدار تاريخی، شهيد مزاري با اصرار فراوان پيشنهادي را براي بنده مطرح كرد و آن اينكه: مسئولين ايراني پذيرفته‌اند براي تربيت قاضي، مجتمع حقوقي را در قم داير و هزينه‌هاي آن را پرداخت نمايند، شما هم بيائيد همكاري كنيد و سرپرستي اين مجتمع را عهده‌دار شويد و بر قبولي سرپرستي مجتمع از سوي اينجانب اصرار و تأكيد فراوان كردند. و من هم با مشاهده اصرار و تأكيد ايشان مسئوليت سرپرستي مجتمع آموزشي حقوقي شهيد بلخي را دركنار مسئوليت شوراي نظارت بر مدارس ديني افغانستان پذيرفتم كه الحمدلله اين مجتمع حقوق يك دوره موفق را پشت سر گذراند و شاگردان خوبي را تربيت نمود كه در حال حاضر بسياري از آنها در مصدر امور حكومتي و اداري دولت افغانستان مشغول خدمت هستند، كه از جمله آنها ميتوان آقاي سرور دانش معاون رئیس جمهور افغانستان را نام برد».
شورای نظارت بر مدارس دینی افغانستان
آیت‌الله العظمی موحدی نجفی«مدظله العالی» سالها علاوه بر عضويت در اين ارگان ديني و مذهبي، دبیر شورای نظارت هم بود که شورای مزبور به سرپرستی معظم له اداره می‌شد و هدف از بنیانگذاری آن، تبلیغ امور دینی و مذهبی، تعلیم و تربیت نیروهای متخصص و متعهد انسانی و اسلامی در راستای پاسداری از انقلاب اسلامی افغانستان و دستاوردهای آن و تلاش و کوشش در جهت هدایت جامعه به منظور تحقق حاکمیت اسلام در تمام شئون اجتماعی، سیاسی، اقتصادی و فرهنگی و برقراری انقلاب مقدس اسلامی در افغانستان بود. همچنين اين شورا مي‌كوشيد علاوه بر حل مشكلات طلاب، رشته‌هاي آموزشي مانند حقوق، مديريت، علوم سياسي و اقتصاد را در جهت به دست آوردن استقلال فرهنگی، اقتصادی و سیاسی از طریق آشنا ساختن دانشجویان با علوم و فنون مدیریتهای مورد نیاز جامعه بر اساس اولویتهای موجود کشور بر قرار سازد كه در اين زمینه تلاشهاي لازم صورت گرفت و موفق شد در جهت وحدت امت اسلامی و در راستای اهتمام به امور مسلمین جهان و تحقق انقلاب بین‌الملل اسلامی، همچنین احقاق حق مستضعفان و ملتهاي مسلمان و مبارزه با قدرتهاي استعماري و استكباري گامهاي مؤثري بردارد.
مجمع جهانی اهل البیت (علیهم السلام)
مرجع عاليقدر از سال 1372ه.ش سالهاي متمادي عضو مجمع جهاني اهل‌بيت«عليهم السلام» بوده و در نشست‌هاي اين مجمع نقش مؤثري را در معرفي انقلاب اسلامي افغانستان به ديگر اعضاء داشته است و در حال حاضر نيز در اين زمينه تلاش و فعاليت چشمگيري دارند.